Chapitre 5 Que sont les ordinations “contraintes” ?
Décrite à l’origine par Rao (1964), les analyses canoniques rassemblent de nombreuses méthodes statistiques combinant les concepts d’ordination et de régression et partageant un but commun, qui est d’identifier la relation entre un ensemble de variables réponse (matrice \(Y\), décrivant généralement la composition en espèces des communautés) et un ensemble de variables explicatives (matrice \(X\), contenant généralement des descripteurs environnementaux).
Les analyses canoniques permettent aux utilisateurs de tester des hypothèses écologiques concernant les facteurs environnementaux qui déterminent la composition des communautés d’espèces. Parmi l’ensemble de méthodes d’analyses canoniques existantes, nous insisterons ici principalement sur l’analyse canonique de redondance (RDA).